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[한주현님강의] DNA 분석 파이프라인(1)

Genome Analysis Tutorial - Intro ❗Public raw Data DNA에서 나타난 유전적 변이(Variant)들을 생물 정보학 툴을 사용해 리눅스 환경에서 찾아보고자 함 - NA 12878이라는 공공데이터 사용 raw데이터(미 가공 상태의 데이터)인 FASTQ에서 기준 서열이라고 불리는 refernce서열에 맞춰 BAM파일을 만든다 BAM파일에서 유전적 변이를 찾아내는 Variant calling 과정을 거쳐 VCF 파일을 만든다 📚배울 내용 및 강의 특징 리눅스 환경에서 DNA mutation (SNV, Indel)을 검출하는 파이프라인 제작 파이프라인을 구성하는 각 툴을 설치하는 방법 학습 각 툴들을 실행하여 분석 파이프라인을 완성하고 결과 파일을 생성 BWA2, GATK4와..

데이터분석/Bioinformatics 2023.10.18
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